※2018年時点の情報なので、現在は異なっている可能性があります

npmリポジトリを削除するには、npmのサポートチームにメールで連絡する必要がある。

その際に行った過去メールを忘れないように残しておく。

To: support@npmjs.com
Title: Please remove all versions of "パッケージ名" package.

Dear NPM Support Team,

My name is 名前 (@アカウント名) and I am the creator of "パッケージ名" package.

https://www.npmjs.com/package/パッケージ名

I am sorry for the inconvenience.
Please remove all versions of "パッケージ名" package.

For better package development, Thank you for your cooperation.