ブックマークレットとショートカットの2つの方法がある。

ブックマークレット

単純にブックマークにスクリプトを埋め込む。
スクリプトはhtml のaタグのhref属性と同じくjavascript:から始める。

javascript:(任意のコード)

ショートカット

iOSアプリのショートカットを選び、Webページ -> JavaScript を選択し、下記のフォーマットでスクリプトを入力する。

(任意のコード)

// ショートカットにスクリプトの実行が終了したことを伝える(これを呼ばないとエラーになる)
completion();

その後Safariを開き、共有メニューからその他 -> ショートカットをオンにすると、共有メニューにショートカットのアイコンが加わる。
その後、再びショートカットアプリに戻り、作成したスクリプトを選択し、「共有シートに表示」を有効にしておく。

そしたら、Safariで好きなページを開き、共有からさきほどのスクリプトを選ぶとコードが実行できるようになる。